Kõik probiootikumid jagunevad mitmeks rühmaks, olenevalt sellest, millel klassifikatsioon põhineb. Probiootikum võib sisaldada mitut komponenti, sellega seoses eristatakse monokomponentseid preparaate, millel on ainult üks kindel bakteriliik. Need mikroorganismid on kahtlemata kasulikud sooltele, eriti mikrofloorale.