Meningokokid on gramnegatiivsed kerakujulised rakud läbimõõduga 0,6–0,8 µm. Patsiendilt võetud materjalist valmistatud määrdudes on neil kohvioa kuju, nad paiknevad sageli paaridena või tetraadidena või juhuslikult, sageli leukotsüütide sees – mittetäielik fagotsütoos.