Mõnel juhul, sagedamini naistel, algab äge püelonefriit ägeda tsüstiidiga (sage ja valulik urineerimine, valu põies, terminaalne hematuuria). Ägeda müelonefriidi muud sümptomid: üldine väsimus, nõrkus, lihas- ja peavalud, isutus, iiveldus, oksendamine.