EEG-analüüsi tehakse salvestamise ajal ja lõpuks pärast selle lõpetamist. Salvestamise ajal hinnatakse artefaktide olemasolu (võrguvooluväljade indutseerimine, elektroodide liikumise mehaanilised artefaktid, elektromüogramm, elektrokardiogramm jne) ja võetakse meetmeid nende kõrvaldamiseks. Hinnatakse EEG sagedust ja amplituudi, tuvastatakse iseloomulikud graafilised elemendid ning määratakse nende ruumiline ja ajaline jaotus.