H. influenzae on gramnegatiivsed pleomorfsed vardakujulised või kokoidsed rakud mõõtmetega (0,2–0,3) x (0,5–2) µm. Nad paiknevad määrdumistes üksikult või paaridena ning mõnikord lühikeste ahelate ja rühmadena. Tihedal söötmel moodustavad nad väikeseid (kuni 1 mm läbimõõduga) ümaraid värvituid kolooniaid. Mikroorganismid on liikumatud, ei moodusta eoseid, kuid on võimalik kapslivormide moodustumine, millega on seotud patogeensed omadused. Patogeen toodab endotoksiini, mille kandjaks peetakse kapsli polüsahhariide.