B12-vitamiini malabsorptsiooni sümptomid tekivad lapse esimestel elukuudel. Märgitakse nõrkust, kahvatust, füüsilise arengu aeglustumist ja kõhulahtisust. Neuroloogilised häired ilmnevad 6-30 kuud pärast esimeste sümptomite ilmnemist: vaimne alaareng, neuropaatia, müelopaatia.